動物檢疫實(shí)驗(yàn)室是從事與動物及其產(chǎn)品有關(guān)的動物傳染病、寄生蟲病的病原學(xué)、免疫學(xué)、酶學(xué)、血清學(xué)、分子生物學(xué)、生物化學(xué)診斷的專設(shè)場所。在實(shí)驗(yàn)室需經(jīng)常使用各種各樣的病原微生物，這些病原微生物不僅對畜禽是致病性的，而且其中一些還可感染人類，如果控制不嚴(yán)引起擴(kuò)散，不僅污染實(shí)驗(yàn)室，導(dǎo)致檢驗(yàn)結(jié)果失敗或混淆，還可能污染周圍環(huán)境，對畜禽造成威脅，甚至引起疫病暴發(fā)；共患疾病還會引起實(shí)驗(yàn)室工作人員感染。引起實(shí)驗(yàn)室感染的病原類型的百分比是，細(xì)菌49.1%，病毒31.6%，立克次氏體11.3%，真菌5.7%，寄生蟲2.3%。因此，要做到檢疫檢驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確，又不造成自身感染和從實(shí)驗(yàn)室擴(kuò)散病原微生物，對動物檢疫實(shí)驗(yàn)室必須有具體的要求。
檢疫實(shí)驗(yàn)室的設(shè)計(jì)，必須符合安全的要求。在從事高危險(xiǎn)性病原微生物工作的實(shí)驗(yàn)室，建筑周圍應(yīng)有寬60cm、深60cm的防鼠溝，實(shí)驗(yàn)室建筑內(nèi)不能有野生嚙齒動物竄入。實(shí)驗(yàn)動物房必須嚴(yán)防動物逃逸，要求門窗嚴(yán)密，動物籠和實(shí)驗(yàn)室動物房門均需扣死或加鎖，特別對于禽類和猴類實(shí)驗(yàn)動物尤其應(yīng)有完善的防護(hù)措施。實(shí)驗(yàn)動物房內(nèi)還需設(shè)有可靠的排氣消毒設(shè)施、高壓滅菌裝置和獨(dú)立的污水處理系統(tǒng)和專門的動物焚尸爐，處理動物尸體及強(qiáng)毒實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的一切垃圾。
無菌室是無菌實(shí)驗(yàn)操作室，應(yīng)設(shè)置在最里面，防止空氣流動引起污染。除設(shè)置無菌室外，也可利用潔凈工作臺和無菌操作箱進(jìn)行無菌操作。
無菌操作室包括操作間、緩沖室和更衣間。操作室不宜過大或過小，緩沖室主要目的是保護(hù)操作室的無菌環(huán)境，避免因空氣對流使外界空氣直接進(jìn)入操作室。同時(shí)，還可以放置恒溫培養(yǎng)箱和離心機(jī)等實(shí)驗(yàn)儀器，使實(shí)驗(yàn)在相對無菌條件下完成，而不必?cái)y出室外。更衣間主要是隔離衣的著裝處。作強(qiáng)毒檢疫的實(shí)驗(yàn)應(yīng)設(shè)置淋浴設(shè)施，進(jìn)出都要淋浴，以保證安全。無菌操作室內(nèi)密閉不透風(fēng)，溫濕度和二氧化碳濃度較高，易滋生細(xì)菌，而且損害工作人員的身體健康，應(yīng)裝置過濾空氣的恒溫恒濕調(diào)節(jié)器。
設(shè)計(jì)無菌操作室時(shí)應(yīng)注意以下幾點(diǎn)：
1.為防止室內(nèi)溫度增高，要選擇陽光不能直接照射到的位置，最好設(shè)在陰面。
2.天花板高度不要超過2m，以保證紫外線燈的有效消毒效果。
3.室內(nèi)要防止空氣流動，宜安裝橫拉門和雙層密閉毛玻璃窗。
4.天花板、地板和四周墻壁要光滑無死角，宜鑲瓷磚或涂油漆，以便于清潔和消毒。
5.恒溫恒濕調(diào)節(jié)器應(yīng)采用空氣室內(nèi)回流和補(bǔ)充少量濾過新空氣系統(tǒng)。
目前普遍采用潔凈工作臺代替無菌操作室。潔凈工作臺具有使用方便、占據(jù)空間少、清理消毒方便等優(yōu)點(diǎn)。潔凈工作種類很多，有平行氣流和垂直氣流，有整機(jī)和組合式，有單人和雙人操作之分。潔凈工作臺工作原理是利用鼓風(fēng)機(jī)，使經(jīng)高效過濾的空氣徐徐通過臺面形成無菌的正氣壓，使外周有菌的空氣不易流入潔凈臺，達(dá)到操作區(qū)無菌的目的。因此，在使用時(shí)，周圍不能有較大的氣流，最好潔凈臺放置在清潔無塵的房間，防止灰塵堵塞濾器，延長使用時(shí)間。
從事水生動物檢疫的實(shí)驗(yàn)室，除應(yīng)符合一般要求外，還要根據(jù)其特點(diǎn)設(shè)置水族箱等。